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| 1 | 5-Methylcytosine RNA Methylation in Arabidopsis Thaliana显示文摘5-Methylcytosine (m 5 C ) 是描绘得好的 DNA 修正,并且主要也在初核质和优核质在丰富的非编码的 RNA 被报导。然而,分发和 m 5 在植物 mRNAs 的 C 仍然保持大部分未知。这里,我们报导 RNA m 5 在由使用 m 5 C RNA immunoprecipitation 由一条深定序的途径列在后面(m 5 C-RIP-seq ) 。LC-MS/MS 和点污点分析揭示 m 5 在各种各样的纸巾并且在不同发展阶段的 C mRNA 修正。m 5 C-RIP-seq 分析识别了 6045 m 5 在 4465 的 C 山峰在年轻幼苗表示了基因。我们发现那 m 5 C 在编码序列,二座山峰在开始 codons 以后并且在站 codons 前立即定位了被充实,并且随低翻译与 mRNAs 被联系活动。我们进一步表明了那 RNA (cytosine-5 )-methyltransferase,tRNA 特定的 methyltransferase 4B (TRM4B ) ,展览 m 5 C RNA methyltransferase 活动。在 TRM4B 的变化在根开发和减少的 m 5 C 山峰。TRM4B 影响涉及根开发的基因的抄本层次,它断然与他们的 mRNA 稳定性和 m 5 C 层次。我们的结果建议那 m 5 在 mRNA 的 C 是新 epitranscriptome 标记 inArabidopsis,并且这修正的那条规定是基因的不可分的部分规章的网络位于 \O 下面植物开发。 | Xuean Cui Zhe Liang Lisha Shen Qian Zhang Shengjie Bao Yuke Geng Bin Zhang Vonny Leo Leah A. Vardy Tiegang Lu Xiaofeng Gu Hao Yu | 2017 | Molecular Plant2017，10，11： | 19 |
| 2 | N6-Methyladenine DNA Methylation in Japonica and Indica Rice Genomes and Its Association with Gene Expression,Plant Development, and Stress Responses显示文摘N6-Methyladenine (6mA)DNA methylation has recently been implicated as a potential new epigenetic marker in eukaryotes,including the dioot modelArabidopsis thaliana.However,the conservation and divergence of 6mA distribution patterns and functions in plants remain elusive.Here we report high-quality 6mA methylomes at single-nucleotide resolution in rice based on substantially improved genome sequences of two rice cultivars,Nipponbare (Nip;Japonica)and 93-11 (Indica).Analysis of 6mA genomic distribution and its association with transcription suggest that 6mA distribution and function is rather conserved between rice and Arabidopsis.We found that 6mA levels are positively correlated with the expression of key stressrelated genes,which may be responsible for the difference in stress tolerance between Nip and 93-11. Moreover,we showed that mutations in DDM1 cause defects in plant growth and decreased 6mA level. Our results reveal that 6mA is a conserved DNA modification that is positively associated with gene expression and contributes to key agronomic traits in plants. | Qian Zhang Zhe Liang Xuean Cui Changmian Ji Yun Li Pingxian Zhang Jingrong Liu Adeel Riaz Pu Yao Min Liu Yunpeng Wang Tiegang Lu Hao Yu Donglei Yang Hongkun Zheng Xiaofeng Gu | 2018 | Molecular Plant2018，11，12： | 18 |
| 3 | The RNA Editing Factor WSP1 Is Essentia for Chloroplast Development in Rice显示文摘尽管在 Arabidopsis thaliana 的质体编辑因素(MORF ) 的多重 organellar RNA 是位于下面 MORF 怎么在另外的种类影响植物开发的广泛地学习的、分子的细节,特别地在米饭,仍然保持大部分未知。这里,我们描述 wsp1 的描述,有白条纹的叶子和圆锥花序的米饭异种。尤其是, wsp1 在出发舞台展出了将近白的不成熟的圆锥花序。传播电子显微镜学分析和叶绿素内容测量揭示了叶绿体在 wsp1 的发展缺点和减少的叶绿素累积。在 Os04g51280 发现一个点变化的 WSP1 的位置的克隆,份额其通常认为的产品高与 MORF 蛋白质定序类似。互补实验证明 WSP1 为 wsp1 的使成杂色的显型负责。WSP1 对叶绿体局部性,在 wsp1 的点变化影响编辑多重 organellar RNA 地点。由于在编辑的质体 RNA 的缺点,叶绿体核糖体生物的续生说并且 ndhA 拼接也在 wsp1 被损害,它可以在出发阶段在叶子和圆锥花序影响正常叶绿体开发。一起,我们的结果在叶绿体开发表明米饭 WSP1 蛋白质的重要性并且在米饭关于 MORF 家庭成员拓宽我们的知识。 | Zhiguo Zhang Xuean Cui Yanwei Wang JinxiaWu Xiaofeng Gu Tiegang Lu | 2017 | Molecular Plant2017，10，1： | 15 |
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