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| 1 | Developing integrative systematics in the informatics and genomic era, and calling for a global Biodiversity Cyberbank显示文摘Systematics 是发现的科学,组织并且解释所有生活有机体的差异。在 genomics 和生物多样性信息科学的最近的开发正在转变 systematics 并且开创了许多新机会。在生物多样性信息科学的主要 digitization 努力和开发帮助了 systematics 社区探索方法在组织提高效率,出版,并且利用系统的信息。同时, genomics 很快正在便于生活的树的建设,改进分类分类,并且解开复杂进化历史。在信息科学和 genomics 时代, systematics 有一个不可思议的能力为发现以及与其它一起与计算、探索的平台集成,当在生物集合和形态学维持它的核心力量时,联系了学科。我们要求将作为生物多样性数据的许多类型的主要仓库工作保证系统的数据的广阔、成长的数量的长期的可持续性的新全球 cyberinfrastructure 或生物多样性 Cyberbank 的建立。这生物多样性 Cyberbank 将为 systematics 研究包含新、有效的分析管道,特别为高效地产生分类处理(修订,电子书和植物群) 。综合 systematics 要求训练下一代的组织主义者与分类, phylogenomic 和信息科学技巧到关于生物多样性和它的集会探讨宏大问题并且继续开发生物多样性 Cyberbank。综合 systematics 必须积极地也为探讨 Anthropocene 的生物多样性危机在 systematics 和集合的重要性上教育公众和政策制造者,并且生物多样性 Cyberbank 可以代表一个强大的工具为超出。 | Jun Wen AJ Harris Stefanie M. Ickert-Bond Rebecca Dikow Kenneth Wurdack Elizabeth A. Zimmer | 2017 | Journal of Systematics and Evolution2017，55，4： | 18 |
| 2 | Chloroplast phylogenomics of the New World grape species (Vitis, Vitaceae)显示文摘Vitis L。(葡萄类) 是经济地很重要的水果庄稼,葡萄和酒的来源。在类以内的种系发生的关系是高度争论的。此处,我们从整个 plastomes 采用顺序数据试图提高 Vitis 种系发生的分辨率。结果作为 monophyletic 支持新世界 Vitis 亚属 Vitis。在 clade 以内, V。californica 是到仍然保持新的姐妹世界 Vitis 亚属 Vitis。在亚属 Vitis 以内,而且,欧亚的 clade 要用体力地被支持并且是到新世界 clade 的姐妹。Vitis vinifera ssp 的 clade。vinifera 和 V。vinifera ssp。sylvestris 是到 Vitis 的核心亚洲人 clade 的姐妹。在北美洲的几普遍的种被发现例如,是在 plastome 树上的 nonmonophyletic 广泛地定义的 Vitis cinerea 和 V。aestivalis 各个需要被分成几种。可能也 nonmonophyly 某种类由于在北美的 Vitis 的杂交的普通出现。由进九个系列的 Munson 的北美的 Vitis 的分类基于种系发生的结果被讨论。分叉时间和系多样化的分析在在晚第三纪开始的北美洲支持 Vitis 的快速的放射。 | Jun Went AJ Harris Yash Kalburgi Ning Zhang Yuan Xu Wei Zheng Stefanie M. Ickert-Bondt Gabriel Johnson Elizabeth A. Zimmer | 2018 | Journal of Systematics and Evolution2018，56，4： | 14 |
| 3 | Inferring the biogeographic origins of inter-continental disjunct endemics using a Bayes-DIVA approach显示文摘arcto 第三级的 relictual 植物群由在东方亚洲,欧洲,东方北美洲,和西方的北美洲的适度的地区非接触地发生的许多类组成。在每个分布区域以内,种类典型地是地方性的并且可以广泛地因此在另外的区域以内与密切相关的种类被分开。分发的这个普通模式源于一个从前更多连续的 arcto 第三级的森林的破碎,这广泛地被接受。导致今日的分离的历史的 biogeographic 事件经常用一条种系发生的途径被调查了。限制到这些以前的研究在祖先的范围重建包括了种系发生的无常和无常。然而,最近描述的 Bayes 歌剧女主角方法处理无常的两种类型。因此,我们使用了 Bayes 歌剧女主角分析重建为从代表 17 个脉管的植物家庭的 23 个分离的类的 185 个地方性的系的茎系分布。特别地,我们问在每四个分布区域以内的地方性的系是否更经常演变从(1 ) 普遍祖先,(2 ) 祖先从另外的区域分散了,或(3 ) 地方性的祖先。我们也考虑了三 biogeographic 机制可以最好在 neotropics 向其这解释 arcto 第三级的分离 endemics 的起源。我们的结果证明东方亚洲 endemics 更经常在欧洲和东方、西方的北美洲与 endemics 相比从地方性的祖先演变。在后者区域的今日的地方性的系更经常从普遍祖先产生了。我们的结果也在在 neotropics 地方性的 arcto 第三级的种类的 biogeographic 起源为疏开的重要性提供轶事证据。 | AJ HARRIS Jun WEN Qiu-Yun (Jenny) XIANG | 2013 | Journal of Systematics and Evolution2013，51，2： | 10 |
| 4 | Long distance dispersal in the assembly of floras: A review of progress and prospects in North America显示文摘这里,我们考察进步和前景明确地为长距离疏开 biogeographic 事件测试。长距离疏开代表一越过某种障碍的 jump,例如一个地志的特征或一个地区不合适气候并且可以包括重复跳,或踏脚石疏开。长距离疏开为解释全体、小的生物多样性的组织由早 biogeographers 可伸缩被认为不可分,例如达尔文和 Wallace。达尔文, Wallace,和其它长想象那因为为疏开的向量例如动物,风,和水流,以非随机的方法表现了,距离疏开是可预言的事件。然而,发现那疏开的这些早 biogeographers 是难的观察,并且,与大陆人飘移的理论的来临,以后, vicariance 变得认为是对生物多样性的安排的更好科学的解释,因为它代表了一个可窜改的假设。因此,长距离疏开在生物地理学被归结为一个讨厌的东西参数;能从未充分在证据在支持了 vicariance 的一种情形被排除的随机的可能性。今天,到有强烈兴趣更充分把长距离疏开集成到理解在地球上的生物多样性的集会和组织。在这评论,我们为明确地测试通过使用包括的长距离疏开假设讨论进步和前景分子,词法, paleontological,和信息科学方法。我们集中于假设测试涉及北美洲的植物群的集会的长距离疏开,由于它的现存、绝灭的生物多样性,它是一个柔韧的初步的学习系统 wellcatalogued。 | AJ Harris Stefanie Ickert-Bond Aaron Rodriguez | 2018 | Journal of Systematics and Evolution2018，56，5： | 6 |
| 5 | Origins of cultivars of Chrysanthemum-Evidence from the chloroplast genome and nuclear LFY gene显示文摘The origins of cultivated chrysanthemums have attracted considerable attention,but they remain poorly known.Here,we reconstructed the phylogeny of representative well-known cultivars and wild species of the genus Chrysanthemum using chloroplast genomes and the nuclear LEAFY gene.Our results suggest that geographic and ecological factors may determine the opportunities for wild species to be involved in the origin of the cultivars.The wild species C.indicum,C.zawadskii,C.dichrum,C.nankingense,C.argyrophyllum,and C.vestitum were likely directly or indirectly involved as paternal species of most of the chrysanthemum cultivars examined in this study.Yet,the maternal species is supported to be a lineage of an extinct wild Chrysanthemum species and its subsequent cultivars,as all accessions of chrysanthemum cultivars sampled formed a strongly supported clade,distinct from all other species of Chrysanthemum in the plastome tree.Thus,the cultivated chrysanthemums originated from multiple hybridizations involving several paternal species rather than only two or a few wild species,with an extinct species and its subsequent cultivars serving as the maternal parents.This finding is consistent with Chrysanthemum having high rates of hybridization and gene flow,which has been demonstrated within previous studies;nevertheless,it is important to unravel the role of an extinct wild Chrysanthemum species as the ultimate maternal parent species for all the chrysanthemum cultivars.Our results also suggest that C.vestitum from Tianzhu and Funiu Mountains in Anhui and Henan Provinces of China represent two distinct cryptic species. | Yue-Ping Ma Liang Zhao Wen-Jie Zhang Ying-Hua Zhang Xia Xing Xia-Xia Duan Jing Hu AJ Harris Pei-Liang Liu Si-Lan Dai Jun Wen | 2020 | Journal of Systematics and Evolution2020，58，6： | 4 |
| 6 | A molecular phylogeny of Staphyleaceae: Implications for generic delimitation and classical biogeographic disjunctions in the family显示文摘Staphyleaceae 传统地包括适度、热带的树和灌木的三个类:Euscaphis Siebold 与 Zucc, Staphylea L. ,和 Tuprinia 发泄。这些类被形态学,而是一个最近的分类清楚地基于四叶绿体基因支持并且原子它的享受 Staphylea, Euscaphis,和在 Staphylea s.l 的新世界 Turpinia 和在 Dalrympelea Roxb 的旧世界 Turpinia。在这研究,我们的目的到过(1 ) 在使用二的 Staphyleaceae 以内解决种系发生的关系原子并且六个叶绿体标记,(2 ) 探索词法 synapomorphies 支持主要 clades,并且(3 ) 在通用定界线和生物地理学上讨论我们的结果的含意。我们的种系发生的结果在 Staphyleaceae 显示出五主要 clades:(1 ) 旧世界 Turpinia,(2 ) 新世界 Turpinia,(3 ) 只旧的世界 Staphylea 的 clade,(4 ) 包括所有新世界种类和旧世界的其余部分的 Staphylea 的亚洲北方的美国 clade,并且(5 ) Euscaphis。在 Staphylea 和 Turpinia 的二 clades 各个以内,传统地使用限定类的词法特征可以展出集中。在在这研究检验的词法特征之中,我们发现那花粉不是分类地增进知识的,叶牙齿展示, epicuticular 给表演打蜡分别地,为 Staphylea 和 Tuprinia 的传统的类限制了支持并且花瓣长度(即,花尺寸)在与新世界 Turpinia 相比的旧世界 Turpinia 是显著地更小的。关于生物地理学,我们的结果支持在东方北美洲和喜马拉雅山脉之间的稀罕分离。 | AJ Harris Ping-Ting Chen Xin-Wei Xu Jian-Qiang Zhang Xue Yang Jun Wen | 2017 | Journal of Systematics and Evolution2017，55，2： | 4 |
| 7 | 2007 Guidelines for the Management of Arterial Hypertension: The Task Force for the Management of Arterial Hypertension of the European Society of Hypertension (ESH) and of the European Society of Cardiology (ESC)显示文摘 | Giuseppe Mancia Guy De Backer Anna Dominiczak Renata Cifkova Robert Fagard Giuseppe Germano Guido Grassi Anthony M Heagerty Sverre E Kjeldsen Stephane Laurent Krzysztof Narkiewicz Luis Ruilope Andrzej Rynkiewicz Roland E Schmieder Harry AJ Struijker Boudi | 2007 | Journal of Hypertension2007，，6： | 2 |
| 8 | 2007 Guidelines for the Management of Arterial Hypertension: The Task Force for the Management of Arterial Hypertension of the European Society of Hypertension (ESH) and of the European Society of Cardiology (ESC)显示文摘 | Giuseppe Mancia Guy De Backer Anna Dominiczak Renata Cifkova Robert Fagard Giuseppe Germano Guido Grassi Anthony M Heagerty Sverre E Kjeldsen Stephane Laurent Krzysztof Narkiewicz Luis Ruilope Andrzej Rynkiewicz Roland E Schmieder Harry AJ Struijker Boudi | 2007 | Journal of Hypertension2007，，6： | 2 |
| 9 | Percutaneous screw fixation of fracture dislocations of the sacroiliac joint显示文摘 | Starr AJ Walter JC Harris RW | 2002 | J Orthop Trauma2002，2，： | 1 |
| 10 | The hypercholesterolaemia ofobstructive jaundice显示文摘 | McIntyre N Harry DS Pearson AJ | 1975 | Gut1975，16，5： | 1 |
| 11 | Factors affecting local re- currence of colonic adenocarcinoma显示文摘 | Harris GJ Church JM Senagore AJ | 2002 | Dis Colon Rectum2002，45，8： | 1 |
| 12 | Inflamma- tion and cancer= interweaving microRNA, free radi- cal, cytokine and p53pathways 显示文摘 | Schetter AJ Heegaard NH Harris CC | 2010 | Carcinogenesis2010，31，1： | 1 |
| 13 | Interactions between commensal intestinal bacteria and the immune system显示文摘 | Macpherson AJ Harris NL | 2004 | Nat Rev Immu- nol2004，4，6： | 1 |
| 14 | Mathematic modeling of the risk of HBV, HCV,and HIV transmission by windowphase donations not detected by NAT 显示文摘 | Jos JA Weusten M Harry AJ | 2002 | Transfusion2002，42，3： | 1 |
| 15 | Percutaneous screw fixation of fracture-dislocations of the sacro-iliac joint显示文摘 | Starr AJ Walter JC Harris RW | 2002 | J Orthop Trauma2002，16，： | 1 |
| 16 | The role of microRNAs in colorectal cancer显示文摘 | Schetter AJ Okayama H Harris CC | 2012 | Cancer J2012，18，3： | 1 |
| 17 | Cortical origin of pathological pain显示文摘 | Harris AJ | 1999 | Lancet1999，354，14： | 1 |
| 18 | Current UK opinion on thromboprophy lyaxis in orthopaedic surgery:Its use in routine total hip and knee arthroplasty显示文摘 | Unuin AJ Jones JR Harries WJ | 1995 | Am R Coll Surg Engl1995，，77： | 1 |
| 19 | Tissue interactions and antlero genesis: new findings revealed by a xenograft approach 显示文摘 | Li C Harris AJ Suttie JM | 2001 | J Exp Zool2001，1，1： | 1 |
| 20 | Interactions between commensal intestinal bacteria and the immune system显示文摘 | MACTXHERSON AJ HARRIS N L | 2004 | Nature Reviews Immunology2004，4，6： | 1 |
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