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水稻条叶枯病毒(RStV)基因组组分4的克隆与序列分析

查看全文 作  者:[1]曲志才;[1]沈大棱;[1]邓可京;[1]吕英芝;[1]李昌本;Hull [2]R 高影响力作者 机构地区:[1]复旦大学遗传学研究所;[2]约翰英纳斯研究中心病毒研究系高影响力机构 出  处:《微生物学报》索引1999年第39卷第1期,共7页高影响力期刊 基  金:美国McKnight基金 摘  要:利用RTPCR技术合成并扩增了水稻条叶枯病毒(RStV)中国云南分离物基因组组分4的全长cDNA,将PCR产物克隆在载体pCRI上,并进行全序列测定,所得核苷酸序列及推测的氨基酸序列与日本分离物T进行比较。结果表明,在核苷酸水平,两分离物的vORF、vcORF及基因间非编码区序列的同源性分别为949%、941%、861%,5’端非编码区序列相同,而3’非编码区同源性为961%,仅有两个核苷酸不同;在氨基酸水平,vORF及vcORF编码蛋白的同源性分别为994%和983%。可见,编码区的大小及其氨基酸序列和两末端序列都是很保守的。因此,中国云南分离物Y与日本分离物T可能有很近的亲缘关系。 关 键 词:水稻条叶枯病毒 水稻条叶枯病 序列分析 基因组
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