我国新分离乙脑病毒02-76株的全基因序列特征

查看全文 作　　者：[1]王环宇 [1]潘晓玲 [1]付士红 [1]王雷 [1]李铭华 Ichiro [2]Kurane [1]梁国栋索引

机构地区：[1]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒性脑炎室,北京100052;[2]JapanNationalInstituteofInfectiousDisease

出　　处：《中华实验和临床病毒学杂志》索引2006年第20卷第3期,共6页

基　　金：国家科技部重大传染病专项(2003BA12A08-01);日本国立传染性疾病研究所课题资助(Japan Health Science Foundation) 摘　　要：目的对我国新分离乙脑病毒02-76株进行全基因序列测定和分析,了解乙脑病毒基因组结构及毒力特性。方法设计乙脑病毒全基因组扩增引物,RT-PCR扩增片段,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因序列。通过Clustal X(1.8)、DNASTAR、GENEDOC(3.2)等生物学软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果新分离乙脑病毒02.76株全基因组全长10977个核苷酸,从96位到10391位,共10296个核苷酸编码一个开放阅读框,编码3432个氨基酸。与我国1949年分离的Beijing-1株相比较共存在248个核苷酸差异,16个氨基酸差异。与GenBank中选择的29株乙脑病毒全基因序列比较发现,其核苷酸总体差异率为0.6%-15.1%,氨基酸总体差异率为0.2%-4.6%。通过PrM/C区段、E区段、3’NTR区段及全基因序列进行系统进化分析均显示该毒株属于基因3型乙脑病毒。结论新分离的乙脑病毒02-76株属于基因3型,与中国分离株SA-14进化关系最接近。 关键词：脑炎病毒日本基因种系发生

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